Ο Αρχιμανδρίτης Μελχισεδέκ απορρίπτει κατηγορίες ότι ζήτησε τη μεσολάβηση άλλων για την εκλογή του, υποστηρίζοντας ότι η εκλογική διαδικασία ήταν καθαρή και διαφανής. Ο ίδιος αναφέρει ότι οι ισχυρισμοί περί παρέμβασης δεν ανταποκρίνονται στην πραγματικότητα και τονίζει την ακεραιότητα της εκκλησιαστικής διαδικασίας.
Στο επίκεντρο της υπόθεσης βρίσκεται και η επικοινωνία του με τον Π. Καμμένο, η οποία φέρεται να συνδέεται με τον μαφιόζο που εμπλέκεται στο κύκλωμα των Χανίων. Οι αποκαλύψεις αυτές έχουν προκαλέσει σοβαρές αντιδράσεις στην τοπική κοινωνία και εγείρουν ερωτήματα σχετικά με τη διαχείριση της εκκλησίας και των σχέσεών της με το οργανωμένο έγκλημα.