Η δημιουργία θαλάσσιων προστατευόμενων περιοχών στο Αιγαίο έχει προκαλέσει νέες εντάσεις στις σχέσεις Ελλάδας-Τουρκίας. Η Άγκυρα αμφισβητεί τα όρια των ελληνικών θαλάσσιων πάρκων, υποστηρίζοντας πως παραβιάζουν τα κυριαρχικά της δικαιώματα και τις διεθνείς συμφωνίες για τα θαλάσσια σύνορα.
Διπλωματικές πηγές αναφέρουν πως το ζήτημα έχει ήδη τεθεί σε διμερείς συναντήσεις υψηλού επιπέδου. Η Αθήνα επιμένει ότι τα θαλάσσια πάρκα αποτελούν περιβαλλοντικό ζήτημα και όχι εργαλείο επέκτασης της επικράτειας, ενώ προτείνει συνεργασία για την προστασία του θαλάσσιου οικοσυστήματος.
