Έντονη πολιτική αντιπαράθεση έχει προκαλέσει η τοποθέτηση του Νίκου Φαραντούρη σχετικά με τη διαχείριση του ΟΠΕΚΕΠΕ. Οι δηλώσεις του, που αφορούν ζητήματα διαφάνειας και αποτελεσματικότητας του Οργανισμού Πληρωμών, προκάλεσαν άμεση αντίδραση από την αντιπολίτευση και αγροτικούς φορείς.
Κυβερνητικές πηγές υπερασπίζονται τη θέση Φαραντούρη, επισημαίνοντας την ανάγκη αναδιοργάνωσης του Οργανισμού. Παράλληλα, εκπρόσωποι αγροτικών συνεταιρισμών εκφράζουν ανησυχίες για τις επιπτώσεις που ενδέχεται να έχουν οι προτεινόμενες αλλαγές στην έγκαιρη καταβολή των επιδοτήσεων και τη στήριξη του αγροτικού κόσμου.